一、管理體系
企業(yè)的有效運行，離不開管理體系，同樣，工程項目管理企業(yè)的有效運行，也離不開管理體系。區(qū)別在于：有的是不自覺應用，有的是主動應用，有的是被動應用。管理體系是一種管理方法，它可為企業(yè)建立管理基礎，但不保證企業(yè)的一切。為此，首先介紹幾種管理體系。
二、企業(yè)運行管理
工程項目管理企業(yè)應從公司層面建立一整套的企業(yè)運行管理的要求、模式等，結合相關管理體系的要求，形成具有企業(yè)自身特色的企業(yè)運行管理的體系，此體系應考慮項目運行管理的需要，并支持其有效運行。
三、項目運行管理
企業(yè)運行管理是項目運行管理的支撐和依托，項目運行管理是企業(yè)運行管理的延伸和具體化，項目管理企業(yè)必須處理好企業(yè)運行管理和項目運行管理兩者關系。
項目管理企業(yè)應根據項目管理運行體系和作業(yè)指導書要求，結合工程項目具體情況，開展項目管理工作。針對具體工程項目，項目管理企業(yè)應做到：符合項目管理體系框架，對作業(yè)指導書內容進行取舍。